Qubes OS ist ein freies Open-Source-Betriebssystem für einen einzelnen Nutzer am Desktop-Rechner, das Sicherheit durch Kompartimentierung erreichen will. Auf Basis des Xen-Hypervisors läuft jede Aktivität in einer eigenen virtuellen Maschine, einer sogenannten Qube, etwa für Arbeit, Privates, den Netzwerkstack oder die Firewall. Qubes können Systeme wie Fedora, Debian oder Windows ausführen, tragen Vertrauensstufen, die durch farbige Fensterrahmen sichtbar sind, und lassen sich als Wegwerf-Instanzen anlegen. Netzwerkkarten und USB-Controller werden isoliert. Das System richtet sich an Menschen, die gezielt angegriffen werden, etwa Journalisten, Aktivisten und Forschende, sowie an erfahrene Nutzer. Qubes OS installieren Sie auf eigener Hardware.
Die Software ist Open Source, überwiegend unter GPL v2. Entwickelt wird sie vom Qubes OS Project, mit Invisible Things Lab als Partner. Da das System lokal läuft und keinen Cloud-Dienst benötigt, bleiben Ihre Daten und Schlüssel auf Ihren eigenen Geräten. Die Dokumentation weist darauf hin, dass Linux-Erfahrung hilft, und das Projekt beschreibt Qubes selbst als vernünftig sicheres Betriebssystem.