Whonix is een besturingssysteem gericht op privacy dat al het internetverkeer via het Tor-netwerk leidt. Het is gebouwd op de geharde Linux-distributie Kicksecure en draait als een set virtuele machines: een gateway die de Tor-verbindingen afhandelt en een aparte werkstation-omgeving waarin de programma's draaien. Whonix kan worden gebruikt met VirtualBox, KVM of Qubes OS, en de website biedt installatiemedia voor Windows-, Linux- en macOS-systemen. De nadruk ligt op anonimiteit en het isoleren van activiteiten.
De broncode van Whonix is gepubliceerd onder OSI-goedgekeurde licenties. Achter het project staat Encrypted Support LLC, volgens het impressum een onderdeel van OTOCO RMI LLC met vestiging op de Marshalleilanden, buiten de EU. Omdat Whonix op de eigen hardware of in lokale virtuele machines draait, kan een organisatie het zelf installeren en controleren. De afhankelijkheid van een niet-EU-onderhouder voor releases en beveiligingsfixes blijft het belangrijkste aandachtspunt.